全自动高压蒸汽灭菌锅多为小型灭菌锅，对于这类灭菌锅必须排净冷空气，如果不排净冷空气，冷空气热膨胀后对压力锅的工作压力有所贡献，此时压力和温度不能一一对应，显示的温度比锅内的实际工作温度高，灭菌锅的工作温度不能达到设定的杀菌温度，会影响灭菌效果。

　　该灭菌锅通过热敏电极监测锅内温度变化，显示屏上显示的温度是锅内真实的工作温度，在冷空气没有排净的情况下，也能够保证灭菌的温度要求。由于饱和水蒸汽的灭菌效果好，所以在使用自动控温型灭菌锅时，也应该排放冷空气，提高灭菌效果，锅下通常设有排水排气阀；

　　全自动高压蒸汽灭菌锅在灭菌时可将排水阀向左（向右为排水）旋转少许，让少量蒸汽排出，也有的灭菌设备上设有可调排气阀，灭菌时，始终保持排气阀处于微开状态，可起到排出冷空气的作用。

　　每次灭菌均会造成锅内水的损耗，故使用前均应对锅内水位进行检查。水位除要没及外层锅中的全部金属的加热圈外，还要留有多余的水量，防止干烧造成对加热部件的损坏。其实，在长期的使用过程中，金属加热圈在外层锅上固定的部位因常常暴露在水位之上而造成的高温熔化致毁的例子并不鲜见，而缺水引起的干烧还会引发安全事故。

　　全自动高压蒸汽灭菌锅为了确保灭菌效果，应定期检查灭菌效果，常用的方法是将硫磺粉末（熔点为115℃）或安息香酸（熔点为120℃）置于试管内，然后进行灭菌试验。如上述物质熔化，则说明高压蒸气灭菌器内的温度已达要求，灭菌的效果是可靠的。也可将检测灭菌器效果的胶纸（其上有温度敏感指示剂）贴于待灭菌的物品外包装上，如胶纸上指示剂变色，亦说明灭菌效果是可靠的。